GERİ DÖN
Ders Öğretim Planı
| Dersin Kodu | Dersin Adı | Dersin Türü | Yıl | Yarıyıl | AKTS |
|---|---|---|---|---|---|
| FBFMB7041 | İntermediyer Metabolizma ve Düzenlenmesi | Ders | 1 | 1 | 5,00 |
Dersin Seviyesi
Doktora
Dersin Sunulduğu Dil
Türkçe
Dersin Amacı
Dersin ana amacı azotlu maddelerin, yağların ve karbonhidratların metabolik yolaklarının derinlemesine analizidir. Ayrıca bu yolakların birbirleriyle nasıl etkileşime girdiğini ve düzenleyici mekanizmalarının neler olduğunu tartışmayı da amaçlamaktadır. Bu ana yolakların aktivitelerinin hormonal ve beslenme koşullarından nasıl etkilendiğine dair daha ileri açıklamalar içermektedir.
Dersi Veren Öğretim Görevlisi Görevlileri
Doç. Dr. Can YILMAZ
Öğrenme Çıktıları
| 1 | Öğrenciler bilimin nasıl işlediğini açıklar, eleştirel söylemde bulunur ve sorunları çözmek için uygun istatistiksel ve hesaplamalı teknikleri kullanır; biyokimyada en ileri teorik ve deneysel metodolojileri seçer. |
| 2 | Öğrenciler biyokimya alan-yazınında uluslararası üne sahip bilimsel iletişimleri inceler ve yorumlar. |
| 3 | Bilimin temel çalışmalarını biyokimyasal düzeyde metodik olarak genelleştirirler, ardından bulgularla diğer çalışma alanlarına doğru dışdeğerlendirme gerçekleştirirler. |
| 4 | Öğrenciler eleştirel söylemlerle uğraşırlar ve uygun deneysel ve teorik modern biyokimyasal metodolojileri seçerek özgün problem çözme stratejileri üretirler. |
| 5 | Sürekli öğrenme talebini kolaylıkla karşılayan en ileri teorik ve teknolojik zorlukları uygularlar. |
| 6 | Öğrenciler biyokimya ile ilgili literatürü hem Türkçe hem de İngilizce olarak okur, analiz eder ve tartışırlar. |
Öğrenim Türü
Birinci Öğretim
Dersin Ön Koşulu Olan Dersler
Dersin ön koşulu bulunmamaktadır.
Ders İçin Önerilen Diğer Hususlar
Yoktur.
Dersin İçeriği
(i) Temel metabolik yolakları, gerçekleşen tepkimeleri ve katalizleyen enzimlerin öğrenilmesi (ii) Karbonhidratların, yağ asitlerinin ve amino asitlerin enerji metabolizmasına katılımlarının ve hormonal düzenlenmesinin öğrenilmesi (iii) Metabolik yolaklardaki enzimlerin kovalent modifikasyon ve allosterik modülasyon ile kontrolü ile farklı metabolik yolaklardaki metabolit alışlarının birbirlerinin üretim/tüketim oranlarını nasıl düzenlediklerinin kavranması (iv) Biyoenformatik araçlar ile metabolik yolaklardaki akışlar arasındaki düzenleyici mekanizmaların gözlenmesi ve çözümlenmesi (v) İntermediyer metabolizmanın düzenlenmesinde doğal düzenlenmenin yanı sıra çeşitli metabolik hastalık ve sendromlardaki sentetik kontrol sistemlerinin ve stratejilerinin öğrenilmesi (vi) Doğal gıdaların ve çeşitli ksenobiyotiklerin (çevresel kirleticiler, yapay gıda katkıları vs) metabolik dengeye etkilerinin moleküler düzeyde irdelenmesi
Haftalık Ayrıntılı Ders İçeriği
| Hafta | Teorik | Uygulama | Laboratuvar |
|---|---|---|---|
| 1 | Metabolizmaya giriş ve metabolik yolakların aracılı düzenleme yolları | Yoktur | Yoktur. |
| 2 | Glukoz yıkımı - glikoliz ve düzenlenmesi | KEGG, WikiPathways | Yoktur. |
| 3 | Glukoz yıkımı - glukoneogenez ve düzenlenmesi | KEGG, WikiPathways | Yoktur. |
| 4 | Glukoz yıkımı - pentoz fosfat yolağı ve düzenlenmesi | KEGG, WikiPathways, Reactome | Yoktur. |
| 5 | Glukoz yıkımı - fermentasyon ve düzenlenmesi | KEGG, WikiPathways, Reactome | Yoktur. |
| 6 | Yağ asidi yıkımı, β-oksidasyonu, peroksizomal β-oksidasyonu ve düzenlenmeleri | KEGG, WikiPathways, Reactome | Yoktur. |
| 7 | Keton cisimleri ve enerji metabolizmasındaki rolleri | KEGG, WikiPathways, Reactome | Yoktur. |
| 8 | Önemli metabolik mekikler: glokoz-alanin, malat-aspartat, açil-karnitin | KEGG, WikiPathways, Reactome | Yoktur. |
| 9 | Sitrik Asit Döngüsü ve substrat mevcudiyeti ve hormonlara göre düzenlenmesi | KEGG, WikiPathways, Reactome | Yoktur. |
| 10 | Elektron Taşıma Sistemi ve enzimatik yolaklara olan bağı | KEGG, WikiPathways, Reactome | Yoktur. |
| 11 | Yağ asidi sentezi ve yağ asidi metabolizmasının bütünsel düzenlenmesi | KEGG, WikiPathways, Reactome | Yoktur. |
| 12 | Kolesterol metabolizması ve düzenlenmesi | KEGG, WikiPathways, Reactome | Yoktur. |
| 13 | Amino asit metabolizması: transaminasyon, oksidatif deaminasyon ve üre sentezi | KEGG, WikiPathways, Reactome | Yoktur. |
| 14 | Amino asit sentezi ve genel düzenlenmesi | KEGG, WikiPathways, Reactome | Yoktur. |
Ders Kitabı Malzemesi Önerilen Kaynaklar
Lehninger Biyokimyanın Temelleri, Nelson ve Cox, 8.baskıdan çeviri, Palma Yayınevi
Planlanan Öğrenme Aktiviteleri ve Metodları
Değerlendirme
| Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri | Adet | Değer |
|---|---|---|
| Ara Sınav | 1 | 60 |
| Ev Ödevi | 5 | 40 |
| Toplam | 100 | |
| Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri | Adet | Değer |
| Final Sınavı | 1 | 100 |
| Toplam | 100 | |
| Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri | 50 | |
| Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri | 50 | |
Staj Durumu
Yoktur.
İş Yükü Hesaplaması
| Etkinlikler | Sayısı | Süresi (saat) | Toplam İş Yükü (saat) |
|---|---|---|---|
| Ara Sınav | 1 | 10 | 10 |
| Final Sınavı | 1 | 20 | 20 |
| Derse Katılım | 14 | 3 | 42 |
| Bireysel Çalışma | 14 | 2 | 28 |
| Ev Ödevi | 5 | 5 | 25 |
| Toplam İş Yükü (saat) | 125 | ||
Program ve Öğrenme Çıktıları İlişkisi
| PÇ 1 | PÇ 2 | PÇ 3 | PÇ 4 | PÇ 5 | PÇ 6 | PÇ 7 | PÇ 8 | PÇ 9 | PÇ 10 | PÇ 11 | PÇ 12 | PÇ 13 | PÇ 14 | PÇ 15 | PÇ 16 | |
| ÖÇ 1 | 3 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 3 | 2 | 4 | 5 | 2 | 3 | 4 | 2 | 2 | 1 |
| ÖÇ 2 | 2 | 5 | 4 | 4 | 2 | 2 | 3 | 4 | 2 | 4 | 3 | 2 | 2 | 1 | 1 | 1 |
| ÖÇ 3 | 4 | 3 | 5 | 4 | 4 | 4 | 5 | 4 | 4 | 3 | 3 | 4 | 4 | 2 | 3 | 1 |
| ÖÇ 4 | 2 | 5 | 5 | 5 | 2 | 3 | 5 | 5 | 4 | 2 | 3 | 4 | 4 | 3 | 3 | 2 |
| ÖÇ 5 | 4 | 4 | 4 | 5 | 3 | 3 | 4 | 4 | 3 | 3 | 4 | 2 | 3 | 2 | 2 | 1 |
| ÖÇ 6 | 3 | 5 | 5 | 5 | 3 | 3 | 4 | 3 | 2 | 4 | 3 | 4 | 4 | 2 | 3 | 1 |
* Katkı Düzeyi : 1 Çok düşük 2 Düşük 3 Orta 4 Yüksek 5 Çok yüksek