GERİ DÖN
Ders Öğretim Planı
| Dersin Kodu | Dersin Adı | Dersin Türü | Yıl | Yarıyıl | AKTS |
|---|---|---|---|---|---|
| FBFMB7043 | İleri Proteomik Teknikler | Ders | 1 | 2 | 5,00 |
Dersin Seviyesi
Yüksek Lisans
Dersin Sunulduğu Dil
Türkçe
Dersin Amacı
Bu dersin amacı, Moleküler Biyoloji ve Genetik Anabilim Dalı başta olmak üzere moleküler biyolojik tekniklerin ve moleküler biyokimya uygulamalarının kullanıldığı tüm araştırma alanlarından yüksek lisans ve doktora öğrencilerine Proteomik çalışmalarda kullanılan ileri seviye, yüksek veri çıkışlı ve yazılım analizleri gerektiren teknikler hakkında genel bilgileri kazandırmak ve uygulama şekillerini tanıtmaktır.
Dersi Veren Öğretim Görevlisi Görevlileri
Doç Dr Can YILMAZ
Öğrenme Çıktıları
| 1 | Bilimsel bilginin hipotezlerin sınanması, ampirik kanıtların değerlendirilmesi ve tümdengelim–endüktif akıl yürütmeyle ilerlediğini açıklayabilir. |
| 2 | Proteomik alanındaki temel kuramları, yapısal, işlevsel ve ifadesel proteomik disiplinlerini kavrayarak, bu bilgileri bilimsel terminolojiyle tanımlayabilir. |
| 3 | Proteomik araştırmaların biyoetik ve toplumsal yansımalarını bilimsel bir bakış açısıyla değerlendirebilir. |
| 4 | Proteomik çalışmalarında kullanılan ileri tekniklerin deneysel tasarım, örnek hazırlama, protein ayırma, analiz ve veri değerlendirme basamaklarını bütüncül bir süreç olarak planlayabilir. |
| 5 | Çeşitli proteomik yöntemleri ve araçlarını karşılaştırarak, araştırma bağlamına en uygun yaklaşımı seçebilir ve bu tercihin olası sonuçlarını öngörebilir. |
| 6 | Proteomik verilerinin doğru toplanması, analizi ve sunumuna yönelik temel becerileri kullanarak eleştirel sorgulama ve bilimsel yazım yoluyla bilgi aktarabilir. |
Öğrenim Türü
Birinci Öğretim
Dersin Ön Koşulu Olan Dersler
Yok
Ders İçin Önerilen Diğer Hususlar
Yok
Dersin İçeriği
(i) Proteomik bilim dalındaki genel ve özel metotları öğrenmek (ii) Yüksek veri çıkışlı bu metotların uygulanma şekillerini ve nedenlerini kavramak (iii) Uygulamaların çıktılarını incelemekte kullanılan analiz yazılımları üzerine bilgi ve deneyim sahibi olmak
Haftalık Ayrıntılı Ders İçeriği
| Hafta | Teorik | Uygulama | Laboratuvar |
|---|---|---|---|
| 1 | Proteomik Bilimine Giriş - “omiks” nedir? | Yok | Yok |
| 2 | Proteomik Bilimine Giriş - Proteomik genel tanımlar | Yok | Yok |
| 3 | Proteomik Bilimine Giriş - Proteomik çalışmanın türleri | Yok | Yok |
| 4 | Proteomik Bilimine Giriş - Proteomik çalışmanın aşamaları | Yok | Yok |
| 5 | Proteomik Çalışmalarda Örnek Hazırlanması - Homojenizasyon tamponu içeriği | Yok | Yok |
| 6 | Proteomik Çalışmalarda Örnek Hazırlanması - Homojenizasyon metotları | Yok | Yok |
| 7 | Protein Örneklerinin Saflaştırılması ve Ayrılması - Liyofilizasyon, Diyaliz | Yok | Yok |
| 8 | Protein Örneklerinin Saflaştırılması ve Ayrılması - Santrifüj / ARA SINAV | Yok | Yok |
| 9 | Protein Örneklerinin Saflaştırılması ve Ayrılması - Jel Filtrasyon Kromatografisi | Yok | Yok |
| 10 | Protein Örneklerinin Saflaştırılması ve Ayrılması - İyon Değişim ve Afinite Kromatografisi | Yok | Yok |
| 11 | Protein Örneklerinin Saflaştırılması ve Ayrılması - Elektroforez ve çeşitleri | Yok | Yok |
| 12 | Protein Örneklerinin Saflaştırılması ve Ayrılması - SDS-PAGE ve IEF | Yok | Yok |
| 13 | Protein Örneklerinin Saflaştırılması ve Ayrılması - Jel Boyama Teknikleri ve Görüntü Analizi | Yok | Yok |
| 14 | Öğrenci Sunumları | Yok | Yok |
| 15 | Final Sınavı |
Ders Kitabı Malzemesi Önerilen Kaynaklar
Ders Notları, internet kaynakları, Introducing Proteomics, Josip Lovric, Wiley-Blackwell, 2011
Planlanan Öğrenme Aktiviteleri ve Metodları
yok
Değerlendirme
| Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri | Adet | Değer |
|---|---|---|
| Ara Sınav | 1 | 100 |
| Toplam | 100 | |
| Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri | Adet | Değer |
| Final Sınavı | 1 | 100 |
| Toplam | 100 | |
| Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri | 50 | |
| Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri | 50 | |
Staj Durumu
Yok
İş Yükü Hesaplaması
| Etkinlikler | Sayısı | Süresi (saat) | Toplam İş Yükü (saat) |
|---|---|---|---|
| Ara Sınav | 1 | 2 | 2 |
| Final Sınavı | 1 | 2 | 2 |
| Problem Çözümü | 14 | 1 | 14 |
| Soru-Yanıt | 14 | 1 | 14 |
| Seminer | 1 | 10 | 10 |
| Makale Kritik Etme | 1 | 5 | 5 |
| Bireysel Çalışma | 14 | 3 | 42 |
| Ara Sınav İçin Bireysel Çalışma | 1 | 15 | 15 |
| Final Sınavı içiin Bireysel Çalışma | 1 | 20 | 20 |
| Toplam İş Yükü (saat) | 124 | ||
Program ve Öğrenme Çıktıları İlişkisi
| PÇ 1 | PÇ 2 | PÇ 3 | PÇ 4 | PÇ 5 | PÇ 6 | PÇ 7 | PÇ 8 | PÇ 9 | PÇ 10 | PÇ 11 | PÇ 12 | PÇ 13 | PÇ 14 | PÇ 15 | PÇ 16 | |
| ÖÇ 1 | 4 | 3 | 5 | 4 | 5 | 3 | 4 | 5 | 3 | 4 | 2 | 4 | 3 | 2 | 3 | 2 |
| ÖÇ 2 | 4 | 4 | 3 | 4 | 4 | 2 | 5 | 4 | 3 | 3 | 2 | 2 | 3 | 1 | 2 | 2 |
| ÖÇ 3 | 2 | 3 | 3 | 3 | 2 | 2 | 3 | 3 | 4 | 2 | 2 | 3 | 3 | 5 | 5 | 5 |
| ÖÇ 4 | 5 | 5 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 5 | 3 | 3 | 2 | 2 | 3 | 1 | 2 | 1 |
| ÖÇ 5 | 3 | 5 | 4 | 5 | 5 | 5 | 5 | 3 | 4 | 3 | 2 | 4 | 3 | 2 | 2 | 2 |
| ÖÇ 6 | 3 | 4 | 5 | 4 | 3 | 3 | 5 | 5 | 4 | 4 | 3 | 5 | 5 | 2 | 2 | 2 |
* Katkı Düzeyi : 1 Çok düşük 2 Düşük 3 Orta 4 Yüksek 5 Çok yüksek