GERİ DÖN
Ders Öğretim Planı
| Dersin Kodu | Dersin Adı | Dersin Türü | Yıl | Yarıyıl | AKTS |
|---|---|---|---|---|---|
| FBFMB7043 | İleri Proteomik Teknikler | Ders | 1 | 2 | 5,00 |
Dersin Seviyesi
Yüksek Lisans
Dersin Sunulduğu Dil
Türkçe
Dersin Amacı
Bu dersin amacı, Moleküler Biyoloji ve Genetik Anabilim Dalı başta olmak üzere moleküler biyolojik tekniklerin ve moleküler biyokimya uygulamalarının kullanıldığı tüm araştırma alanlarından yüksek lisans ve doktora öğrencilerine Proteomik çalışmalarda kullanılan ileri seviye, yüksek veri çıkışlı ve yazılım analizleri gerektiren teknikler hakkında genel bilgileri kazandırmak ve uygulama şekillerini tanıtmaktır.
Dersi Veren Öğretim Görevlisi Görevlileri
Dr Öğr Uyesi Can YILMAZ
Öğrenme Çıktıları
| 1 | Öğrenciler ileri proteomik tekniklerin ne tür çalışmalar için kullanıldığını, günümüz proteom araştırmalarında kullanılış şekillerini öğrenirler |
| 2 | Öğrenciler proteomik bilim dalı kapsamında kullanılan moleküler enstrümanların çalışma mekanizmalarını tanır ve yüksek veri akışının nasıl değerlendirildiğini kavrarlar |
| 3 | Öğrenciler bu tür tekniklerin “wet-bench” uygulamalarındaki püf noktaları ve veri analizlerinde ve “image processor” niteliğindeki yazılımları kullanım yeteneğini kazanırlar |
Öğrenim Türü
Dersin Ön Koşulu Olan Dersler
Yok
Ders İçin Önerilen Diğer Hususlar
Yok
Dersin İçeriği
(i) Proteomik bilim dalındaki genel ve özel metotları öğrenmek (ii) Yüksek veri çıkışlı bu metotların uygulanma şekillerini ve nedenlerini kavramak (iii) Uygulamaların çıktılarını incelemekte kullanılan analiz yazılımları üzerine bilgi ve deneyim sahibi olmak
Haftalık Ayrıntılı Ders İçeriği
| Hafta | Teorik | Uygulama | Laboratuvar |
|---|---|---|---|
| 1 | Proteomik teknikler üzerine genel bilgi | Yok | Yok |
| 2 | Örnek hazırlanmasında kullanılan genel metotlar ve farkları; protein özütleme tekniklerinin kritik önemi | Yok | Yok |
| 3 | native-PAGE ve SDS-PAGE metotları ve uygulama alanları | Yok | Yok |
| 4 | 2-DE Metodu-İzoelektrik Fokuslama | Yok | Yok |
| 5 | 2-DE-İkinci boyut (jel koşturma prosedürü ve püf noktaları) | Yok | Yok |
| 6 | Jel Görüntüleme Teknikleri-Jel Boyama teknikleri; Kromofor, Floresan ve Immunolojik nitelikte boyamalar | Yok | Yok |
| 7 | Vize | Yok | Yok |
| 8 | Jel Görüntüleme Teknikleri-Kamera Sistemleri; Lamba ve Filtre Opsiyonları | Yok | Yok |
| 9 | 2-DE jellerinde spot analizleri-Jel Analiz Programları hakkında genel bilgiler | Yok | Yok |
| 10 | 2-DE jellerinde spot analizleri-Ludesi REDFIN yazılımında uygulama | Yok | Yok |
| 11 | Kütle Spektrometresi-Genel kavramlar, kullanım alanları, çalışma mekanizması | Yok | Yok |
| 12 | Kütle Spektrometresi- Çeşitleri ve bölümleri (MALDI-MS/MS, LC-MS/MS) | Yok | Yok |
| 13 | Kütle Spektrometresi-Veri çıktıları ve veri analiz yazılımları hakkında genel bilgiler | Yok | Yok |
| 14 | Kütle Spektrometresi-Veri analiz yazılımları uygulama (Proteomatic Pipeline) | Yok | Yok |
Ders Kitabı Malzemesi Önerilen Kaynaklar
Ders Notları
Planlanan Öğrenme Aktiviteleri ve Metodları
Değerlendirme
| Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri | Adet | Değer |
|---|---|---|
| Ara Sınav | 1 | 100 |
| Toplam | 100 | |
| Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri | Adet | Değer |
| Final Sınavı | 1 | 100 |
| Toplam | 100 | |
| Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri | 40 | |
| Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri | 60 | |
Staj Durumu
Yok
İş Yükü Hesaplaması
| Etkinlikler | Sayısı | Süresi (saat) | Toplam İş Yükü (saat) |
|---|---|---|---|
| Ara Sınav | 1 | 2 | 2 |
| Final Sınavı | 1 | 2 | 2 |
| Rapor Hazırlama | 1 | 20 | 20 |
| Rapor Sunma | 1 | 1 | 1 |
| Proje Hazırlama | 1 | 20 | 20 |
| Bireysel Çalışma | 13 | 3 | 39 |
| Ara Sınav İçin Bireysel Çalışma | 1 | 15 | 15 |
| Final Sınavı içiin Bireysel Çalışma | 1 | 20 | 20 |
| Toplam İş Yükü (saat) | 119 | ||
Program ve Öğrenme Çıktıları İlişkisi
| PÇ 1 | PÇ 2 | PÇ 3 | PÇ 4 | PÇ 5 | PÇ 6 | PÇ 7 | PÇ 8 | PÇ 9 | PÇ 10 | PÇ 11 | PÇ 12 | PÇ 13 | PÇ 14 | PÇ 15 | PÇ 16 | |
| ÖÇ 1 | 4 | 5 | 5 | 4 | 5 | 5 | 3 | 5 | 3 | 4 | 3 | 3 | 5 | 5 | 3 | 3 |
| ÖÇ 2 | 3 | 3 | 4 | 5 | 3 | 3 | 5 | 3 | 4 | 4 | 5 | 4 | 3 | 4 | 5 | 4 |
| ÖÇ 3 | 5 | 4 | 5 | 3 | 4 | 3 | 3 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 3 | 3 |
* Katkı Düzeyi : 1 Çok düşük 2 Düşük 3 Orta 4 Yüksek 5 Çok yüksek