| Dersin Kodu | Dersin Adı | Dersin Türü | Yıl | Yarıyıl | AKTS |
|---|---|---|---|---|---|
| FBFMB7035 | Bitki Filogenetiği I | Ders | 1 | 1 | 5,00 |
Yüksek Lisans
Türkçe
Bu dersin sonunda öğrencilerin, filogeniyle (evrimsel soy ilişkileriyle) ilgili temel kavramları bilmeleri ve uygulayabilmeleri beklenmektedir.
Prof. Ayten Dizkırıcı Tekpınar
| 1 | Öğrenciler, filogeninin ne olduğunu tanımlayabilir. |
| 2 | Öğrenciler, temel analiz programlarını ve DNA veri tabanlarını kullanabilir. |
| 3 | Öğrenciler, DNA dizilimi hakkında gerekli bilgilere sahip olur. |
| 4 | Öğrenciler, DNA’nın nasıl izole edildiğini ve dizilendiğini anlar. |
| 5 | Öğrenciler, bir filogenetik ağaç oluşturabilir |
Birinci Öğretim
[Yok]
Filogeni kavramı, evrimsel ilişkilerin belirlenmesinde kullanılan morfolojik ve moleküler veriler, bitkilerin ana soy hatları, bitki sınıflandırmasının tarihsel gelişimi, kladistik analiz, filogenetik ağaçların oluşturulması ve yorumlanması.
| Hafta | Teorik | Uygulama | Laboratuvar |
|---|---|---|---|
| 1 | DNA izolasyonu (CTAB metodu) | ||
| 2 | DNA izolasyonu (CTAB metodu) | ||
| 3 | Polimeraz Zincir Reaksiyonu (PCR) | ||
| 4 | DNA Sekanslama (Kromatogram) | ||
| 5 | Analiz (MEGA) | ||
| 6 | NCBI Data Base | ||
| 7 | NCBI Data Base II | ||
| 8 | NCBI-Finding and Loading of the sequences / Arasınav | ||
| 9 | Bitki Filogenetiği (http://www.youtube.com/watch?v=BFen8vyO3YY) | ||
| 10 | Filogenetiğe genel bakış & Kladogram (http://www.youtube.com/watch?v=zSYzdms0SsU) (http://www.youtube.com/watch?v=e4Yq41EypHc) (http://www.youtube.com | ||
| 11 | Constructing phylogenetic tree | ||
| 12 | Classification (http://www.youtube.com/watch?v=6IRz85QNjz0) | ||
| 13 | Klad veya Monofiletik Grup (http://www.youtube.com/watch?v=-SPvEPMs1TI) (http://www.youtube.com/watch?v=jnDgpUX_j1w) Kladogram kısımları | ||
| 14 | Makale okuma | ||
| 15 | Final Sınavı |
| Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri | Adet | Değer |
|---|---|---|
| Ara Sınav | 1 | 40 |
| Quiz | 1 | 10 |
| Derse Katılım | 1 | 10 |
| Uygulama/Pratik | 12 | 10 |
| Laboratuvar | 3 | 10 |
| Performans | 12 | 20 |
| Toplam | 100 | |
| Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri | Adet | Değer |
| Final Sınavı | 1 | 100 |
| Toplam | 100 | |
| Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri | 40 | |
| Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri | 60 | |
| Etkinlikler | Sayısı | Süresi (saat) | Toplam İş Yükü (saat) |
|---|---|---|---|
| Ara Sınav | 1 | 1 | 1 |
| Final Sınavı | 1 | 2 | 2 |
| Quiz | 1 | 1 | 1 |
| Derse Katılım | 12 | 1 | 12 |
| Uygulama/Pratik | 12 | 2 | 24 |
| Laboratuvar | 3 | 3 | 9 |
| Soru-Yanıt | 12 | 3 | 36 |
| Makale Kritik Etme | 4 | 2 | 8 |
| Performans | 12 | 2 | 24 |
| Toplam İş Yükü (saat) | 117 | ||
| PÇ 1 | PÇ 2 | PÇ 3 | PÇ 4 | PÇ 5 | PÇ 6 | PÇ 7 | PÇ 8 | PÇ 9 | PÇ 10 | PÇ 11 | PÇ 12 | PÇ 13 | PÇ 14 | PÇ 15 | PÇ 16 | |
| ÖÇ 1 | 4 | 4 | 5 | 4 | 5 | 5 | 4 | 4 | 5 | 5 | 4 | 4 | 5 | 4 | 5 | 4 |
| ÖÇ 2 | 4 | 4 | 5 | 5 | 5 | 4 | 5 | 4 | 5 | 4 | 5 | 4 | 5 | 4 | 5 | 5 |
| ÖÇ 3 | 4 | 4 | 5 | 5 | 5 | 4 | 4 | 5 | 5 | 4 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 |
| ÖÇ 4 | 5 | 5 | 4 | 5 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 5 | 4 | 5 | 4 | 5 | 4 |
| ÖÇ 5 | 4 | 5 | 5 | 5 | 4 | 5 | 4 | 4 | 5 | 4 | 4 | 5 | 4 | 5 | 4 | 4 |