GERİ DÖN

Ders Öğretim Planı


Dersin Kodu Dersin Adı Dersin Türü Yıl Yarıyıl AKTS
FBFMB7035 Bitki Filogenetiği I Ders 1 1 5,00

Yüksek Lisans


Türkçe


Bu dersin sonunda öğrencilerin, filogeniyle (evrimsel soy ilişkileriyle) ilgili temel kavramları bilmeleri ve uygulayabilmeleri beklenmektedir.


Prof. Ayten Dizkırıcı Tekpınar


1 Öğrenciler, filogeninin ne olduğunu tanımlayabilir.
2 Öğrenciler, temel analiz programlarını ve DNA veri tabanlarını kullanabilir.
3 Öğrenciler, DNA dizilimi hakkında gerekli bilgilere sahip olur.
4 Öğrenciler, DNA’nın nasıl izole edildiğini ve dizilendiğini anlar.
5 Öğrenciler, bir filogenetik ağaç oluşturabilir

Birinci Öğretim



[Yok]


Filogeni kavramı, evrimsel ilişkilerin belirlenmesinde kullanılan morfolojik ve moleküler veriler, bitkilerin ana soy hatları, bitki sınıflandırmasının tarihsel gelişimi, kladistik analiz, filogenetik ağaçların oluşturulması ve yorumlanması.


Hafta Teorik Uygulama Laboratuvar
1 DNA izolasyonu (CTAB metodu)
2 DNA izolasyonu (CTAB metodu)
3 Polimeraz Zincir Reaksiyonu (PCR)
4 DNA Sekanslama (Kromatogram)
5 Analiz (MEGA)
6 NCBI Data Base
7 NCBI Data Base II
8 NCBI-Finding and Loading of the sequences / Arasınav
9 Bitki Filogenetiği (http://www.youtube.com/watch?v=BFen8vyO3YY)
10 Filogenetiğe genel bakış & Kladogram (http://www.youtube.com/watch?v=zSYzdms0SsU) (http://www.youtube.com/watch?v=e4Yq41EypHc) (http://www.youtube.com
11 Constructing phylogenetic tree
12 Classification (http://www.youtube.com/watch?v=6IRz85QNjz0)
13 Klad veya Monofiletik Grup (http://www.youtube.com/watch?v=-SPvEPMs1TI) (http://www.youtube.com/watch?v=jnDgpUX_j1w) Kladogram kısımları
14 Makale okuma
15 Final Sınavı



Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri Adet Değer
Ara Sınav 1 40
Quiz 1 10
Derse Katılım 1 10
Uygulama/Pratik 12 10
Laboratuvar 3 10
Performans 12 20
Toplam 100
Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri Adet Değer
Final Sınavı 1 100
Toplam 100
Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri 40
Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri 60


Etkinlikler Sayısı Süresi (saat) Toplam İş Yükü (saat)
Ara Sınav 1 1 1
Final Sınavı 1 2 2
Quiz 1 1 1
Derse Katılım 12 1 12
Uygulama/Pratik 12 2 24
Laboratuvar 3 3 9
Soru-Yanıt 12 3 36
Makale Kritik Etme 4 2 8
Performans 12 2 24
Toplam İş Yükü (saat) 117

PÇ 1 PÇ 2 PÇ 3 PÇ 4 PÇ 5 PÇ 6 PÇ 7 PÇ 8 PÇ 9 PÇ 10 PÇ 11 PÇ 12 PÇ 13 PÇ 14 PÇ 15 PÇ 16
ÖÇ 1 4 4 5 4 5 5 4 4 5 5 4 4 5 4 5 4
ÖÇ 2 4 4 5 5 5 4 5 4 5 4 5 4 5 4 5 5
ÖÇ 3 4 4 5 5 5 4 4 5 5 4 5 5 5 5 5 5
ÖÇ 4 5 5 4 5 4 4 4 4 4 4 5 4 5 4 5 4
ÖÇ 5 4 5 5 5 4 5 4 4 5 4 4 5 4 5 4 4
* Katkı Düzeyi : 1 Çok düşük 2 Düşük 3 Orta 4 Yüksek 5 Çok yüksek