GERİ DÖN

Ders Öğretim Planı


Dersin Kodu Dersin Adı Dersin Türü Yıl Yarıyıl AKTS
SBEMB7023 Bilgisayarlı Modelleme ile İlaç Tasarımı Ders 1 1 5,00

Yüksek Lisans


Türkçe


Bu derste Bilgisayarlı modelleme ile öğrencinin ilaç-enzim ilişkisine üç boyutlu bakması ve daha detaylı bilgi alması hususunda ileri derecede bilgilerin verilmesi amaçlanır


Doç. Dr. Nurettin Mengeş


1 Bilgisayarlı modellemenin ilaç endüstrisine ve araştırmasına önemi hakkında bilgi sahibi olur
2 Modelleme sayesinde ne tür bilgiler elde edeceğini öğrenir
3 Modelleme sırasında hangi metotların hangi amaçlarla kullanılması gerektiğini öğrenir
4 Protein ve ligandların üç boyutlu olarak nasıl göründüğünü ve ikisi arasında nasıl bir etkileşim olabileceğini öğrenir.


Yok


Bu konuda dersi alan öğrencilerin temel bilgisayar ve sağlık bilgisine sahip olması istenir


Derste bu alandaki ileri noktada hangi metotlar kullanılacağı anlatılacaktır. Ders içeriğinde daha çok yapı-aktivite ilişkisinin kurulması, kantitatif yapı-etki ilişkisi ve Docking gibi konular anlatılacaktır.


Hafta Teorik Uygulama Laboratuvar
1 Bilgisayarlı Modellemede Kullanılan Metotlara Genel Bakış
2 Yapı-Aktivite İlişkisi (SAR) Nasıl Kurulur ?
3 Kantitatif Yapı aktivite İlişkisi (QSAR) Nasıl Kurulur ?
4 Kantitatif Yapı aktivite İlişkisi (QSAR) Nasıl Kurulur ?
5 QSAR için Hangi modellemeler Yapılır.
6 QSAR ve Docking'in önemi ve Aralarındaki farklar
7 QSAR ve Docking'in önemi ve Aralarındaki farklar
8 Vize Sınavı
9 QSAR ile ilgili örnek çalışmalar
10 QSAR ile ilgili örnek çalışmalar
11 Docking metodunun tanıtılması ve öğretilmesi
12 Docking için örnek çalışmalar
13 Docking için örnek çalışmalar
14 Docking için örnek çalışmalar
15 Docking için örnek çalışmalar
16 Final Sınavı

Computational Drug Design, Willam C. Young, Wiley, 2009



Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri Adet Değer
Ara Sınav 1 50
Bireysel Çalışma 5 20
Ev Ödevi 5 30
Toplam 100
Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri Adet Değer
Final Sınavı 1 100
Toplam 100
Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri 40
Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri 60

Yok


Etkinlikler Sayısı Süresi (saat) Toplam İş Yükü (saat)
Ara Sınav 1 2 2
Final Sınavı 1 2 2
Quiz 2 2 4
Derse Katılım 1 1 1
Problem Çözümü 6 2 12
Tartışma 1 1 1
Proje Hazırlama 2 2 4
Bireysel Çalışma 14 4 56
Ödev Problemleri için Bireysel Çalışma 5 3 15
Ev Ödevi 10 2 20
Toplam İş Yükü (saat) 117

PÇ 1 PÇ 2 PÇ 3
ÖÇ 1 4 4 4
ÖÇ 2 4 3 3
ÖÇ 3 4 3 4
ÖÇ 4 3 4 4
* Katkı Düzeyi : 1 Çok düşük 2 Düşük 3 Orta 4 Yüksek 5 Çok yüksek