GERİ DÖN
Ders Öğretim Planı
| Dersin Kodu | Dersin Adı | Dersin Türü | Yıl | Yarıyıl | AKTS |
|---|---|---|---|---|---|
| SBTEB7006 | Mikrobiyolojide Kullanılan Moleküler Teknikler | Ders | 1 | 2 | 5,00 |
Dersin Seviyesi
Yüksek Lisans
Dersin Sunulduğu Dil
Dersin Amacı
Mikrobiyolojide kullanılan moleküler tanı yöntemlerini öğretmeyi, amaca uygun metodu seçebilme ve temel metodları uygulama ve sonuçları değerlendirebilme yeteneğini kazandırmayı amaçlamaktadır
Dersi Veren Öğretim Görevlisi Görevlileri
Prof. Dr. Gülhan BORA
Öğrenme Çıktıları
| 1 | Moleküler mikrobiyolojinin temel kavramlarını, kullanım alanlarını ve mikroorganizmaların genetik düzeyde incelenmesine yönelik temel yaklaşımları açıklar. |
| 2 | DNA/RNA izolasyonu, PCR, qPCR, RT-PCR, multipleks PCR ve elektroforez gibi temel moleküler tekniklerin çalışma prensiplerini ve uygulama alanlarını değerlendirir. |
| 3 | Moleküler yöntemlerin mikrobiyal tanı, tiplendirme, moleküler epidemiyoloji, antimikrobiyal direnç genlerinin belirlenmesi ve klinik/araştırma uygulamalarındaki önemini tartışır. |
| 4 | Sekanslama, yeni nesil dizileme, metagenomik, mikrobiyom analizi ve temel biyoinformatik yaklaşımları kullanarak moleküler verileri yorumlar ve mikrobiyoloji alanında araştırma tasarımı oluşturur. |
Öğrenim Türü
Birinci Öğretim
Dersin Ön Koşulu Olan Dersler
Yok
Ders İçin Önerilen Diğer Hususlar
Yok
Dersin İçeriği
Bu ders; mikrobiyolojide moleküler tanı ve analiz yaklaşımlarını, nükleik asit izolasyonu, PCR temelli yöntemler, kantitatif PCR, ters transkripsiyon PCR, multipleks PCR, jel elektroforezi, DNA/RNA analizleri, sekanslama teknolojileri, metagenomik yaklaşımlar, mikrobiyal genotipleme yöntemleri, moleküler epidemiyoloji, antimikrobiyal direnç genlerinin moleküler düzeyde belirlenmesi, biyoinformatik veri analizi ve moleküler tekniklerin klinik, çevresel ve araştırma alanlarındaki kullanımını kapsamaktadır.
Haftalık Ayrıntılı Ders İçeriği
| Hafta | Teorik | Uygulama | Laboratuvar |
|---|---|---|---|
| 1 | Moleküler mikrobiyolojiye giriş: temel kavramlar, kullanım alanları ve tarihsel gelişim | ||
| 2 | Mikrobiyal genom yapısı, genetik varyasyonlar ve moleküler hedefler | ||
| 3 | DNA ve RNA izolasyon yöntemleri; örnek hazırlama, kalite ve kantite değerlendirmesi | ||
| 4 | Nükleik asit amplifikasyon teknikleri: PCR prensipleri ve uygulamaları | ||
| 5 | Real-Time PCR, RT-PCR ve multipleks PCR teknikleri | ||
| 6 | Jel elektroforezi, restriksiyon enzim analizleri ve moleküler doğrulama yöntemleri | ||
| 7 | Mikrobiyal tanıda moleküler yöntemler ve klinik uygulamalar | ||
| 8 | Ara sınav + Antimikrobiyal direnç genlerinin moleküler yöntemlerle belirlenmesi | ||
| 9 | Mikrobiyal tiplendirme yöntemleri: RFLP, RAPD, AFLP, MLST ve PFGE | ||
| 10 | DNA sekanslama yöntemleri: Sanger sekanslama ve yeni nesil dizileme teknolojileri | ||
| 11 | Metagenomik, mikrobiyom analizleri ve 16S rRNA gen dizileme | ||
| 12 | Moleküler epidemiyoloji ve salgın analizlerinde moleküler tekniklerin kullanımı | ||
| 13 | Biyoinformatik araçlar, veri yorumlama ve moleküler yöntemlerde kalite kontrol | ||
| 14 | Öğrenci sunumları / Makale analizi | ||
| 15 | Final sınavı |
Ders Kitabı Malzemesi Önerilen Kaynaklar
Planlanan Öğrenme Aktiviteleri ve Metodları
Değerlendirme
| Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri | Adet | Değer |
|---|---|---|
| Ara Sınav | 1 | 100 |
| Toplam | 100 | |
| Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri | Adet | Değer |
| Final Sınavı | 1 | 100 |
| Toplam | 100 | |
| Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri | 40 | |
| Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri | 60 | |
Staj Durumu
Yok
İş Yükü Hesaplaması
| Etkinlikler | Sayısı | Süresi (saat) | Toplam İş Yükü (saat) |
|---|---|---|---|
| Ara Sınav | 1 | 1 | 1 |
| Final Sınavı | 1 | 1 | 1 |
| Derse Katılım | 14 | 3 | 42 |
| Ara Sınav İçin Bireysel Çalışma | 3 | 14 | 42 |
| Final Sınavı içiin Bireysel Çalışma | 3 | 14 | 42 |
| Toplam İş Yükü (saat) | 128 | ||
Program ve Öğrenme Çıktıları İlişkisi
| PÇ 1 | PÇ 2 | PÇ 3 | |
| ÖÇ 1 | 3 | 3 | 3 |
| ÖÇ 2 | 2 | 3 | 3 |
| ÖÇ 3 | 3 | 4 | 4 |
| ÖÇ 4 | 3 | 3 | 4 |
* Katkı Düzeyi : 1 Çok düşük 2 Düşük 3 Orta 4 Yüksek 5 Çok yüksek