GERİ DÖN
Ders Öğretim Planı
| Dersin Kodu | Dersin Adı | Dersin Türü | Yıl | Yarıyıl | AKTS |
|---|---|---|---|---|---|
| SBTBE7020 | Çoklu Dizi Hizalamaları | Ders | 0 | 2 | 5,00 |
Dersin Seviyesi
Yüksek Lisans
Dersin Sunulduğu Dil
Türkçe
Dersin Amacı
Bu dersin amacı, çoklu dizi hizalamalarının uygulama alanlarını öğrenmektir.
Dersi Veren Öğretim Görevlisi Görevlileri
Dr. Öğr.Üyesi Abdulhamit BATTAL
Öğrenme Çıktıları
| 1 | Biyolojik veri tabanlarının temellerinin anlama ve moleküler biyoloji ve genetik kapsamında kullanılabilme |
| 2 | İki veya daha fazla dizi için karşılaştırma araçlarının tanımlanabilmesi ve benzerlik/uyumsuzluk durumunun tartışılabilmesi |
| 3 | Protein-RNA ve DNA arasındaki bilgi akışını anlayabilme ve büyük ölçekli biyolojik verilerin çeşitli biyoinformatik temelli araçlar kullanarak analiz edebilme |
Öğrenim Türü
Dersin Ön Koşulu Olan Dersler
Yok
Ders İçin Önerilen Diğer Hususlar
Yok
Dersin İçeriği
Bu ders kapsamında, biyolojik veritabanlarının ve bazı biyoinformatik araç ve yaklaşımların DNA-RNA ve protein arasındaki bilgi akışının daha iyi anlaşılabilmesi amacıyla araştırılması ve tartışılması amaçlanmaktadır.
Haftalık Ayrıntılı Ders İçeriği
| Hafta | Teorik | Uygulama | Laboratuvar |
|---|---|---|---|
| 1 | Biyoinformatiğe giriş-1 | ||
| 2 | Biyoinformatiğe giriş-2 | ||
| 3 | DNA, RNA, | ||
| 4 | Proteinler | ||
| 5 | Biyoinformatiğin Uygulama Alanları | ||
| 6 | Biyoinformatik Veri Tabanları | ||
| 7 | İki DNA/protein dizisinin karşılaştırılması: alignment-1 | ||
| 8 | Ara Sınav | ||
| 9 | İki DNA/protein dizisinin karşılaştırılması: alignment-2 | ||
| 10 | Blastn | ||
| 11 | Blastp | ||
| 12 | Prosite Translate Uygulaması | ||
| 13 | Dizi Hizalama 1 | ||
| 14 | Dizi Hizalama 2 | ||
| 15 | Dizi Hizalama 3 | ||
| 16 |
Ders Kitabı Malzemesi Önerilen Kaynaklar
Biyoinformatik Temelleri ve Uygulamaları, Editör: Doç.Dr. Mehmet Cengiz BALOĞLU, 2018
Planlanan Öğrenme Aktiviteleri ve Metodları
Değerlendirme
| Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri | Adet | Değer |
|---|---|---|
| Ara Sınav | 1 | 100 |
| Toplam | 100 | |
| Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri | Adet | Değer |
| Final Sınavı | 1 | 100 |
| Toplam | 100 | |
| Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri | 50 | |
| Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri | 50 | |
Staj Durumu
Yok
İş Yükü Hesaplaması
| Etkinlikler | Sayısı | Süresi (saat) | Toplam İş Yükü (saat) |
|---|---|---|---|
| Ara Sınav | 1 | 1 | 1 |
| Final Sınavı | 1 | 1 | 1 |
| Derse Katılım | 14 | 3 | 42 |
| Tartışma | 3 | 3 | 9 |
| Soru-Yanıt | 5 | 2 | 10 |
| Bireysel Çalışma | 4 | 2 | 8 |
| Ara Sınav İçin Bireysel Çalışma | 1 | 15 | 15 |
| Final Sınavı içiin Bireysel Çalışma | 1 | 20 | 20 |
| Ev Ödevi | 2 | 5 | 10 |
| Toplam İş Yükü (saat) | 116 | ||
Program ve Öğrenme Çıktıları İlişkisi
| PÇ 1 | PÇ 2 | PÇ 3 | |
| ÖÇ 1 | 4 | ||
| ÖÇ 2 | 4 | ||
| ÖÇ 3 | 5 |
* Katkı Düzeyi : 1 Çok düşük 2 Düşük 3 Orta 4 Yüksek 5 Çok yüksek