GERİ DÖN
Ders Öğretim Planı
| Dersin Kodu | Dersin Adı | Dersin Türü | Yıl | Yarıyıl | AKTS |
|---|---|---|---|---|---|
| SBTEB7016 | Mikrobiyolojide Kullanılan Moleküler Teknikler | Ders | 1 | 2 | 5,00 |
Dersin Seviyesi
Yüksek Lisans
Dersin Sunulduğu Dil
Türkçe
Dersin Amacı
Laboratuarın tanıtılması ve demonstrasyon, tampon ve çözeltilerin hazırlanması, DNA ekstraksiyonu, PCR uygulama , Agaroz jel elektroforezi , Jel görüntüleme ve değerlendirme
Dersi Veren Öğretim Görevlisi Görevlileri
Doç. Dr. Gülhan BORA
Öğrenme Çıktıları
| 1 | Moleküler mikrobiyoloji laboratuvarında kullanılan cihaz, ekipman, alet ve malzemeleri kullanabilme |
| 2 | Polimearz zincir reaksiyonu (PCR) ve PCR tabanlı teknikleri (ERIC, REP, AP, RAPD, BOX) uygulayabilme ve optimize edebilme |
| 3 | PCR tekniği için gerekli öncü nükleotid dizilerini (primer) dizayn edebilme |
| 4 | Agaroz jelde DNA elektroforezi ve jel boyama yöntemlerini uygulayabilme |
| 5 | DNA’nın restriksiyon enzimleri ile kesilmesi ve uzunluklarının belirlenmesi (PCR/RFLP) tekniğini kullanabilme |
Öğrenim Türü
Dersin Ön Koşulu Olan Dersler
Yok
Ders İçin Önerilen Diğer Hususlar
Yok
Dersin İçeriği
Moleküler mikrobiyoloji laboratuvarında kullanılan cihaz, ekipman, alet ve malzemeler, Nükleik asit çoğaltma yöntemleri, Plazmid, DNA ve RNA izolasyonu, PCR ve optimizasyonu, PCR tipleri: multipleks, nested, real-time, hot-start, PCR tabanlı yöntemler: ERIC, REP, AP, RAPD, BOX, PCR ürünlerinin saptanması, agaroz jel elektroforezi, Agaroz jelden DNA eldesi, PCR ürünlerini saflaştırma, Restriksiyon enzimleri, Restriksiyon enzimlerine dayalı yöntemler: Plazmid tiplendirme, PCR- Restriction Fragment Length Polymorphism (PCR/RFLP), Pulsed-Field Jel Elektroforezi (PFGE), Amplified Fragment Length Polymorphism (AFLP), DNA baz dizi analizi
Haftalık Ayrıntılı Ders İçeriği
| Hafta | Teorik | Uygulama | Laboratuvar |
|---|---|---|---|
| 1 | Moleküler mikrobiyoloji laboratuvarında kullanılan cihaz, ekipman, alet ve malzemeler | ||
| 2 | Nükleik asit çoğaltma yöntemleri | ||
| 3 | Plazmid, DNA ve RNA izolasyonu | ||
| 4 | PCR ve optimizasyonu | ||
| 5 | PCR tipleri: multipleks, nested, real-time, hot-start | ||
| 6 | PCR tabanlı yöntemler: ERIC, REP, AP, RAPD, BOX | ||
| 7 | PCR ürünlerinin saptanması, agaroz jel elektroforezi | ||
| 8 | Ara sınav | ||
| 9 | Agaroz jelden DNA eldesi, PCR ürünlerini saflaştırma | ||
| 10 | Restriksiyon enzimleri | ||
| 11 | Restriksiyon enzimlerine dayalı yöntemler: Plazmid tiplendirme, PCR- Restriction Fragment Length Polymorphism (PCR/RFLP) | ||
| 12 | Pulsed-Field Jel Elektroforezi (PFGE), Amplified Fragment Length Polymorphism (AFLP) | ||
| 13 | DNA baz dizi analizi | ||
| 14 | PCR teknikleri | ||
| 15 | PCR teknikleri | ||
| 16 | Yarıyıl Sonu Sınavı |
Ders Kitabı Malzemesi Önerilen Kaynaklar
Planlanan Öğrenme Aktiviteleri ve Metodları
Değerlendirme
| Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri | Adet | Değer |
|---|---|---|
| Ara Sınav | 1 | 100 |
| Toplam | 100 | |
| Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri | Adet | Değer |
| Final Sınavı | 1 | 100 |
| Toplam | 100 | |
| Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri | 40 | |
| Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri | 60 | |
Staj Durumu
Yok
İş Yükü Hesaplaması
| Etkinlikler | Sayısı | Süresi (saat) | Toplam İş Yükü (saat) |
|---|---|---|---|
| Ara Sınav | 1 | 1 | 1 |
| Final Sınavı | 1 | 1 | 1 |
| Derse Katılım | 14 | 4 | 56 |
| Makale Kritik Etme | 7 | 2 | 14 |
| Ara Sınav İçin Bireysel Çalışma | 1 | 20 | 20 |
| Final Sınavı içiin Bireysel Çalışma | 1 | 30 | 30 |
| Toplam İş Yükü (saat) | 122 | ||
Program ve Öğrenme Çıktıları İlişkisi
| PÇ 1 | PÇ 2 | PÇ 3 | |
| ÖÇ 1 | 3 | ||
| ÖÇ 2 | 3 | ||
| ÖÇ 3 | 3 | ||
| ÖÇ 4 | 4 | ||
| ÖÇ 5 | 5 |
* Katkı Düzeyi : 1 Çok düşük 2 Düşük 3 Orta 4 Yüksek 5 Çok yüksek