GERİ DÖN
Ders Öğretim Planı
| Dersin Kodu | Dersin Adı | Dersin Türü | Yıl | Yarıyıl | AKTS |
|---|---|---|---|---|---|
| FBFKM7174 | Biyoelektrokimya | Ders | 1 | 2 | 5,00 |
Dersin Seviyesi
Yüksek Lisans
Dersin Sunulduğu Dil
Türkçe
Dersin Amacı
Biyolojik elektron taşıması, redoks enzimlerin elektrokimyası, NAD(P)H dayalı biyosensörler ve fenolik biyosensör sistemlerin temel çalışma prensiplerin matematiksel bağıntılarla öğretmek
Dersi Veren Öğretim Görevlisi Görevlileri
Dr. Öğr. Üyesi Muhammet GÜLER
Öğrenme Çıktıları
| 1 | Öğrenciler, elektron taşıma sistemini, kemozmotik teoriyi ve redoks bileşenlerini matematiksel bağıntılarla öğrenir. |
| 2 | Öğrenciler, enzim aracılı elektrokimyayı, enzimler ile elektrotlar arasındaki doğrudan elektron transfer sistemini öğrenir. |
| 3 | Öğrenciler, membran yapısını ve bileşenlerini, membran yapısının modellerini, lipit ikili tabakanın faz geçişlerini, membran potansiyellerini, membranlardaki taşıma sistemini, membran reseptörlerini ve hücresel sinyalleri ve lipit filmi ile yüklü elektrotları öğrenir. |
| 4 | Öğrenciler, NAD(P)+/NAD(P)H sisteminin elektrokimyasını, çözünür kofaktörleri, elektrokatalitik NAD(P)H oksidasyonu için medyatörleri ve NAD(P)H bağlı dehidrogenaz enzim biyosensörleri öğrenir. |
| 5 | Öğrenciler, fenolik biyosensörler için kullanılan enzimleri, fenolik biyosensörlerin yapımını ve fenolik biyosensörlerin uygulamalarını öğrenir. |
Öğrenim Türü
Dersin Ön Koşulu Olan Dersler
None
Ders İçin Önerilen Diğer Hususlar
None
Dersin İçeriği
Biyolojik elektron taşıma sistemleri, redoks enzimler ve çalışma prensipleri, Biyolojik membranlar, NAD(P)H dayalı biyosensörler ve oluşturma yöntemleri, Fenolik bileşiklerin biyosensörler ile tayin edilmesi
Haftalık Ayrıntılı Ders İçeriği
| Hafta | Teorik | Uygulama | Laboratuvar |
|---|---|---|---|
| 1 | Biyolojik elektron taşıma sistemleri a) Giriş, b) Kemozmotik teori, c) Elektron taşıma zincirleri, d) Redoks bileşenleri | ||
| 2 | e) Uygulama esasları | ||
| 3 | Redoks enzimlerin elektrokimyası a) Giriş, b) Aracı enzimlerin elektrokimyası, c) Elektrot ve enzimler arasında gerçekleşen doğrudan elektron taşıması | ||
| 4 | Biyolojik membranlar ve lipit film yüklü biyosensörler a) Giriş, b) Membran yapısı ve bileşenleri, c) Membran yapısının modelleri | ||
| 5 | d) Lipit ikili tabakaların faz geçişleri, e) Lipit ikili tabakaların mekanik özellikleri, f) Membran potansiyelleri | ||
| 6 | g) Membranlardaki taşıma, h) Membran reseptörleri ve hücre sinyali, i) Lipit film yüklü elektrotlar | ||
| 7 | NAD(P) bağlı biyosensörler a) Giriş, b) NAD(P)+/NAD(P)H sisteminin elektrokimyası, c) NAD(P)H’ın doğrudan elektrokimyasal oksidasyonu | ||
| 8 | d) Çözünür kofaktörler, e) Elektrokatalitik NAD(P)H oksidasyonu için medyatörler, | ||
| 9 | f) NAD(P)H bağlı dehidrogenaz enzimlerin biyosensör sistemleri | ||
| 10 | Fenolik biyosensörler a) Giriş, b) Fenolik biyosensörler için kullanılan enzimler | ||
| 11 | c) Fenolik biyosensörlerin tasarımı | ||
| 12 | d) Fenolik biyosensörlerin uygulamaları | ||
| 13 | Bütün hücre biyosensörleri | ||
| 14 | Tartışma |
Ders Kitabı Malzemesi Önerilen Kaynaklar
Bartlett, P.N. (2008). Bioelectrochemistry, Fundamentals, Experimental Techniques and Applications. John Wiley & Sons Ltd, The Atrium, Southern Gate, Chichester, West Sussex PO19 8SQ, England. 1. H. Lodish, A. Berk, P. Matsudaira, C. A. Kaiser, M. Krieger, M. P. Scott, S. L. Zipursky and J. Darnell, Mol. Cell Biol. 5th edn., W. H. Freeman, New York, 2003. 2. P. Mitchell, Coupling of phosphorylation to electron and hydrogen transfer by a chemi-osmotic type of mechanism, Nature, 191, 144–148 (1961). 3. P. Mitchell, Keilin.s respiratory chain concept and its chemiosmotic consequences, Science, 206, 1148–1159 (1979). 4. R. A. Capaldi, R. and Aggeler, Mechanism of the F1F0-type ATP synthase, a biological rotary motor, Trends Biochem. Sci., 27, 154–160 (2002). 5. M. J. Tarlov and E. F. Bowden, Electron transfer reaction of cytochrome c adsorbed on carboxylic acid terminated alkanethiol monolayer electrodes, J. Am. Chem. Soc., 113, 1847–1849 (1991). 6. R. A. Marcus and N. Sutin, Electron transfers in chemistry and biology, Biochim. Biophys. Acta, 811, 265–322 (1985). 7. G. McLendon, Long-distance electron transfer in proteins and model systems, Acc. Chem. Res., 21, 160–167 (1988). 8. M. Dequaire, B. Limoges, J. Moiroux and J. M. Sav_eant, Mediated electrochemistry of horseradish peroxidase. Catalysis and inhibition, J. Am. Chem. Soc., 124, 240–253 (2002).
Planlanan Öğrenme Aktiviteleri ve Metodları
Değerlendirme
| Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri | Adet | Değer |
|---|---|---|
| Ara Sınav | 1 | 60 |
| Quiz | 1 | 40 |
| Toplam | 100 | |
| Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri | Adet | Değer |
| Final Sınavı | 1 | 100 |
| Toplam | 100 | |
| Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri | 50 | |
| Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri | 50 | |
Staj Durumu
None
İş Yükü Hesaplaması
| Etkinlikler | Sayısı | Süresi (saat) | Toplam İş Yükü (saat) |
|---|---|---|---|
| Ara Sınav | 1 | 20 | 20 |
| Final Sınavı | 1 | 20 | 20 |
| Derse Katılım | 14 | 3 | 42 |
| Ödev Problemleri için Bireysel Çalışma | 14 | 2 | 28 |
| Ara Sınav İçin Bireysel Çalışma | 1 | 10 | 10 |
| Toplam İş Yükü (saat) | 120 | ||
Program ve Öğrenme Çıktıları İlişkisi
| PÇ 1 | PÇ 2 | PÇ 3 | PÇ 4 | PÇ 5 | PÇ 6 | PÇ 7 | PÇ 8 | PÇ 9 | PÇ 10 | |
| ÖÇ 1 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 3 | 5 | 5 |
| ÖÇ 2 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 3 | 5 | 5 |
| ÖÇ 3 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 3 | 5 | 5 |
| ÖÇ 4 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 3 | 5 | 5 |
| ÖÇ 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 3 | 5 | 5 |
* Katkı Düzeyi : 1 Çok düşük 2 Düşük 3 Orta 4 Yüksek 5 Çok yüksek