GERİ DÖN

Ders Öğretim Planı


Dersin Kodu Dersin Adı Dersin Türü Yıl Yarıyıl AKTS
FBZZT7108 Gen Haritalama Teknikleri Ders 1 1 5,00

Yüksek Lisans


İngilizce


Bu dersin sonunda öğrenci; - Gen haritalama araçlarini olan molekuler belirteçleri - Gen baglanti analizini - Gen (QTL) ve kromozom haritalama gibi konuları öğrenmiş olacaktır



1 Gen Haritalarının Önemi ve Oluşturulması Yöntemlerinin Öğrenilmesi
2 Gen Haritalarını okuma ve yararlanma


Yok


Yok


Gen Bağlantı Haritalama ve Teknikleri (Linkage Analysis): LOD skoru ve Rekombinasyon oranı saptama, Allel frekansları saptama teknikleri, Kromozom Haritalama ve Teknikleri; FISH, QTL


Hafta Teorik Uygulama Laboratuvar
1 Karmaşık özelliklerin Araştırılmasında Moleküler Araçlar-I: Protein Belirteçleri (markerleri) (İsozomlar, kan proteinleri)
2 Karmaşık özelliklerin Araştırılmasında Moleküler Araçlar-II: Gen Belirteçleri (markerleri) : RFLP,Mikro ve minisatelliteler, STS,SSR, RAPD, AFLP ve SNP
3 Gen Bağlantı Haritalama ve Teknikleri (Linkage Analysis): LOD skoru ve Rekombinasyon oranı saptama, Allel frekansları saptama
4 Kromozom Haritalama ve Teknikleri (Kromozom Fiziksel Haritası): FISH tekniği (florousant in situ hybridization)
5 Canlılar arası Kıyaslamalı Kromozom Haritalama ve Teknikleri
6 QTL ve Kromozom Aralık Haritalama ve Teknikleri-I: Regresyon ile Interval Mapping, genom haritalama
7 QTL ve Kromozom Aralık Haritalama ve Teknikleri-II: Haplotip belirleme ve öz-üvey kardeş analizi (sib-pair analysis), cM-cM genom haritalama,
8 QTL uygulama-I
9 QTL uygulama-II
10 Bağlantı Eşitliği ve Eşitsizliği(Linkage Equilibrium (LE) ve Disequilbrium (LD)) Altında QTL Analizi-I
11 Bağlantı Eşitliği ve Eşitsizliği(Linkage Equilibrium (LE) ve Disequilbrium (LD)) Altında QTL Analizi-II
12 Radyasyon Hibrit Teknikleri ile Haritalama: RH mapping
13 HapMap Projesi ve Uygulamaları
14 QTN Map Projesi, GWAS ve Uygulamaları

1. Gene Mapping Strategies. 1998. Ders notlari. Animal Sciences of University of Wisconsin-Madison. 1998, . Kirkpatrick, B. 2. İlgili internet sayfalari İlgili veri tabanları ve sofwareler



Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri Adet Değer
Ara Sınav 1 50
Uygulama/Pratik 1 10
Seminer 2 20
Ödev Problemleri için Bireysel Çalışma 0 20
Toplam 100
Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri Adet Değer
Final Sınavı 1 100
Toplam 100
Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri 40
Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri 60

Yok


Etkinlikler Sayısı Süresi (saat) Toplam İş Yükü (saat)
Ara Sınav 1 5 5
Final Sınavı 1 8 8
Problem Çözümü 14 5 70
Soru-Yanıt 14 3 42
Toplam İş Yükü (saat) 125

PÇ 1 PÇ 2 PÇ 3 PÇ 4 PÇ 5 PÇ 6 PÇ 7 PÇ 8 PÇ 9 PÇ 10 PÇ 11 PÇ 12 PÇ 13 PÇ 14 PÇ 15 PÇ 16 PÇ 17 PÇ 18 PÇ 19
ÖÇ 1 4 4 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5
ÖÇ 2 5 5 5 5 5 4 5 5 4 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5
* Katkı Düzeyi : 1 Çok düşük 2 Düşük 3 Orta 4 Yüksek 5 Çok yüksek