GERİ DÖN
Ders Öğretim Planı
| Dersin Kodu | Dersin Adı | Dersin Türü | Yıl | Yarıyıl | AKTS |
|---|---|---|---|---|---|
| FFBİY4045 | Gen Haritalamada Temel Kavramlar | Seçmeli Ders Grubu | 4 | 7 | 5,00 |
Dersin Seviyesi
Lisans
Dersin Sunulduğu Dil
Türkçe
Dersin Amacı
Gen haritalama, kromozomlar üzerindeki lokuslar ve genler arasındaki mesafeleri tanımlamak ve gen dizilişindeki varyasyonları belirlemek için kullanılan yöntemleri açıklamak. Tüm genom haritalamasının özünü, genom üzerindeki ilgili konumlarına moleküler marker koleksiyonu yerleştirme yöntemlerini açıklamak. Genlerin, genom haritalarının yapımında özel bir tip genetik işaretleyici olarak kullanımını göstermek ve haritalanabilirliğinin açıklanması.
Dersi Veren Öğretim Görevlisi Görevlileri
Dr. Öğr. Üyesi Sibel KIZILDAĞ
Öğrenme Çıktıları
| 1 | Gen haritalama mantığı ve kullanım alanlarını açıklayabilir. |
| 2 | Genlerin kromozomlara yerleşimini açıklar. |
| 3 | Organizmaların gen havuzu ve genetik çeşitlilik ile gen haritalama ilişkisini anlatabilir. |
| 4 | Kodlama yapmayan dizi bölgelerinin anlar. |
| 5 | Gen haritalamanın gelecekteki perspektifini gösterebilir. |
| 6 | Öğrenciler DNA klonlaması hakkında bilgileri yorumlayabilir. |
| 7 | Öğrenciler Restriksiyon enzimleri ve elektroforez hakkında bilgi sahibi olur. |
| 8 | Ligasyon, transformasyon ve rekombinantların analizi hakkında bilgi sahibi olur. |
Öğrenim Türü
Birinci Öğretim
Dersin Ön Koşulu Olan Dersler
Ders İçin Önerilen Diğer Hususlar
[Yok]
Dersin İçeriği
Gen haritalama nedir? Amacı ve konsepti. Kromozom üzerinde gen belirlemesi ve genler arasındaki uzaklıkların ölçülmesi. Ökaryotlarda kromozom haritalama. Ökaryotlarda Gen haritalama. Prokaryotlarda gen haritalama. Virüs Plazmid ve faj genomunun haritalanması.
Haftalık Ayrıntılı Ders İçeriği
| Hafta | Teorik | Uygulama | Laboratuvar |
|---|---|---|---|
| 1 | Gen Haritalama nedir? Tarihsel perspektifte kısa bir inceleme. | ||
| 2 | Fiziksel ölçekte kromozom üzerinde genlerin lokalizasyonu ve aralarındaki mesafe, bağlı genler ve krosing-over ilişkisi (SantiMorgan kuramı) | ||
| 3 | Kromozom sayısı ve her bir kromozomda bulunan gen sayısı ve genlerin her bir kromozoma dağılımı | ||
| 4 | Ökaryotlarda kromozom Haritalama | ||
| 5 | Gen Haritalama Stratejileri | ||
| 6 | Ökaryotlarda Gen Haritalama I | ||
| 7 | Ökaryotlarda Gen Haritalama II | ||
| 8 | Drosophila melanogaster (sirke sineği) gen haritası ve vize sınavı | ||
| 9 | İnsan Gen Haritalaması I | ||
| 10 | İnsan Gen Haritalaması II | ||
| 11 | Prokaryotlarda Gen Haritalaması I | ||
| 12 | Prokaryotlarda Gen Haritalaması II | ||
| 13 | Virus, plazmid ve faj genomlarının haritalaması I | ||
| 14 | Virus, plazmid ve faj genomlarının haritalaması II | ||
| 15 | Final Sınavı |
Ders Kitabı Malzemesi Önerilen Kaynaklar
1. Jian Q. Feng, Xianghong Luan, John Wallace, Dai Jing, Toshio Ohshima, Ashok B. Kulkarni, Rena N. D’Souza, Christine A. Kozak, and Mary MacDougallGenomic Organization, Chromosomal Mapping, and Promoter Analysis of the Mouse Dentin Sialophosphoprotein (Dspp) Gene, Which Codes for Both Dentin Sialoprotein and Dentin Phosphoprotein. J. Biol. Chem. 1998 273: 9457-. doi:10.1074/jbc.273.16.9457 2. Johnston, D., St. The art and design of genetic screens: Drosophila melanogaster. Nature Reviews Geneticsvolume 3, pages176–188 (2002). 3. M Hijikata, N Kato, Y Ootsuyama, M Nakagawa, and K Shimotohno.Gene mapping of the putative structural region of the hepatitis C virus genome by in vitro processing analysis. PNAS July 1, 1991 88 (13) 5547-5551; 4. Kozak, C. A.,gatignol, A.Kenneth,G, Jeang, K.T.Mcbride, O. W.Genetic mapping in human and mouse of the locus encoding TRBP, a protein that binds the TAR region of the human immunodeficiency virus (HIV-1) https://doi.org/10.1016/0888-7543(95)80110-8
Planlanan Öğrenme Aktiviteleri ve Metodları
Proje ödevi hazırlama
Değerlendirme
| Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri | Adet | Değer |
|---|---|---|
| Ara Sınav | 1 | 80 |
| Proje Sunma | 1 | 20 |
| Toplam | 100 | |
| Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri | Adet | Değer |
| Final Sınavı | 1 | 90 |
| Proje Sunma | 1 | 10 |
| Toplam | 100 | |
| Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri | 40 | |
| Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri | 60 | |
Staj Durumu
İş Yükü Hesaplaması
| Etkinlikler | Sayısı | Süresi (saat) | Toplam İş Yükü (saat) |
|---|---|---|---|
| Final Sınavı | 1 | 3 | 3 |
| Derse Katılım | 14 | 3 | 42 |
| Bireysel Çalışma | 14 | 3 | 42 |
| Ev Ödevi | 2 | 14 | 28 |
| Toplam İş Yükü (saat) | 115 | ||
Program ve Öğrenme Çıktıları İlişkisi
| PÇ 1 | PÇ 2 | PÇ 3 | PÇ 4 | PÇ 5 | PÇ 6 | PÇ 7 | PÇ 8 | PÇ 9 | PÇ 10 | PÇ 11 | PÇ 12 | PÇ 13 | PÇ 14 | PÇ 15 | PÇ 16 | |
| ÖÇ 1 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 3 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 3 | 2 | 4 | 4 |
| ÖÇ 2 | 3 | 4 | 4 | 4 | 3 | 4 | 3 | 2 | 3 | 2 | 3 | 3 | 3 | 4 | 4 | 3 |
| ÖÇ 3 | 3 | 3 | 2 | 4 | 2 | 3 | 3 | 4 | 4 | 3 | 3 | 3 | 2 | 4 | 4 | 5 |
| ÖÇ 4 | 4 | 4 | 4 | 3 | 3 | 3 | 3 | 2 | 4 | 3 | 4 | 3 | 5 | 4 | 3 | 5 |
| ÖÇ 5 | 4 | 3 | 4 | 4 | 3 | 4 | 4 | 2 | 2 | 2 | 4 | 3 | 3 | 2 | 4 | 3 |
| ÖÇ 6 | 4 | 3 | 4 | 3 | 2 | 2 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 3 | 4 | 3 | 4 | 2 |
| ÖÇ 7 | 4 | 2 | 4 | 4 | 2 | 4 | 3 | 4 | 4 | 4 | 4 | 2 | 4 | 3 | 4 | 2 |
| ÖÇ 8 | 4 | 4 | 4 | 2 | 4 | 4 | 2 | 3 | 3 | 3 | 3 | 2 | 2 | 3 | 1 | 4 |
* Katkı Düzeyi : 1 Çok düşük 2 Düşük 3 Orta 4 Yüksek 5 Çok yüksek